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/ MacWorld 1997 September / Macworld (1997-09).dmg / Serious Software / Cherwell Scientific Demos / gNMR□□ / gNMR365_PPC / gNMR PPC version / gNMR PPC version.rsrc / STR#_2300.txt < prev    next >
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Text File  |  1996-08-01  |  4.8 KB  |  155 lines

  1. Change default settings for the gNMR programs here. To activate the new defaults: click Save, quit and restart program
  2.  
  3.  
  4.  
  5. Click to discard any changes made to the preferences
  6.  
  7. Click to save changes; they will become active when the program is restarted
  8.  
  9. Select an item to move to a different set of preferences
  10.  
  11. Set the default spectrometer frequency (for 1H, in MHz); frequencies for other nuclei will be calculated from it
  12.  
  13. Switch the default chemical-shift scale between ppm and Hz
  14.  
  15. Switch the default lineshape function between Lorentzian, Gaussian and triangular
  16.  
  17. Uncheck this box for anisotropic (partially oriented) spectra
  18.  
  19. Check this box to always include coupling to quadrupolar isotopes.
  20.  
  21. Isotopomers below this abundance will be ignored in all calculations
  22.  
  23. Set the maximum scratchfile size (in Kb) for gNMR, gSPG, etc.
  24.  
  25. Check this box if you always want to go through the File/New dialog when creating a new file
  26.  
  27. Use symmetry to simplify calculations? Symmetry can be based on numerical values or on variable names.
  28.  
  29. Check this box to allow use of symmetry in combination with assignment iteration.
  30.  
  31. Threshold value for the use of perturbation theory to simplify calculations. Set to zero to disable use of perturbation theory.
  32.  
  33. Method used for approximating large systems.Size to start approximate calculations.Strong-coupling threshold for approximate calculations.Start correlation factor in full-lineshape iteration
  34.  
  35. Increase of correlation factor after each cycle of full-lineshape iteration
  36.  
  37. Try sign changes in full-lineshape iteration ?
  38.  
  39. Number of random restarts in full-lineshape iteration
  40.  
  41. Ordering of peaks for assignments
  42.  
  43. Treshold factor for displaying peaks for assignment
  44.  
  45. Treat close-together peaks as a single peak in assignment?
  46.  
  47. Threshold for grouping peaks for assignment (in Hz)
  48.  
  49. Display a title with the spectrum ?
  50.  
  51. Display scaling info with the spectrum ?
  52.  
  53. Display axes with the spectrum ?
  54.  
  55. Display labels at the axes ?
  56.  
  57. The baseline can be displayed in gNMR as a dotted line. It will never appear in hardcopies
  58.  
  59. The baseline can be displayed in gSPG as a dotted line. It will never appear in hardcopies
  60.  
  61. List all parameters in Log file for each print or hardcopy ?
  62.  
  63. Show assignments in double-trace spectrum displays?Switch between cm and inch length units
  64.  
  65. Set the default horizontal spectrum size
  66.  
  67. Set the default vertical spectrum size
  68.  
  69. Set the default absolute vertical spectrum size
  70.  
  71. Use absolute vertical scaling?
  72.  
  73. (Invert the horizontal axis ? - not yet implemented)
  74.  
  75. (Rotate the horizontal axis ? - not yet implemented)
  76.  
  77. Linewidth (in 1/72", between 0 and 1) to be used for hardcopies
  78.  
  79. Check to use PostScript commands for LaserWriters
  80.  
  81. Check to include PostScript commands in spectra copied to the clipboard; copies may become large !
  82.  
  83. You can change the default enlargement factor for the "Copy * 8" menu item
  84.  
  85. Set the number of spectrum changes that can be undone in geSPG
  86.  
  87. Switch the default geSPG peak-removal method between interpolation and truncation
  88.  
  89. Set the default geSPG spectrum smooth order
  90.  
  91. Set the default geSPG spectrum compress order
  92.  
  93. Set the default geSPG Fourier order for baseline correction
  94.  
  95. Set the default geSPG number of points for the spline baseline approximation
  96.  
  97. Font size used for normal text
  98.  
  99. Font size used for "small" text (e.g., in the Choose Nucleus dialog)
  100.  
  101. Font used for normal static text
  102.  
  103. Sample of normal static text
  104.  
  105. Sample of small static text
  106.  
  107. Font used for normal editable text
  108.  
  109. Sample of normal editable text
  110.  
  111. Font size used for text in spectra
  112.  
  113. Font used for text in spectra
  114.  
  115. Sample of text used in spectra
  116.  
  117. Check to automatically expand common abbreviations (Et, Ph, ‚Ķ) when importing structures
  118.  
  119. Check to automatically saturate imported structures with hydrogens
  120.  
  121. 1H nuclei: include all, none, or only those labeled "1H"
  122.  
  123. C(13) nuclei: include all, none, or only those labeled "1H"
  124.  
  125. Abundant heteroatom nuclei (S = 1/2 only): include all, none, or only those labeled with an isotope name
  126.  
  127. Rare and quadrupolar heteroatom nuclei: include all, none, or only those labeled with an isotope name
  128.  
  129. Check to let gNMR try to predict shifts for imported structures
  130.  
  131. Check to let gNMR try to predict coupling constants for imported structures
  132.  
  133. Change quality of Hardcopies and Clipboard copies
  134.  
  135. Thickness of lines used for Hardcopies and Clipboard copies, in 1/72"; must be <= 1
  136.  
  137. Check to use PostScript commands for Laser printer output for improved quality
  138.  
  139. Check to include PostScript commands in clipboard copies; increases size of copy but improves print quality
  140.  
  141. Set the magnification factor for the "Copy *8" command
  142.  
  143. If checked, spectra will adapt their size to their enclosing window
  144.  
  145. If checked, peaks being assigned will be highlighted in spectra
  146.  
  147. New preferences are only read on program startup. Quit and restart gNMR to use the new preferences
  148.  
  149. Atom labeling for imported structures
  150.  
  151. Average bond length for imported structures
  152.  
  153. Click for AppleGuide online help
  154.  
  155.